《双点博物馆》可以看做是《主题医院》的续集作品，在原有的框架之下所设计的，因此设施建筑和员工管理以及课题这三个依旧是核心玩法。完整的内容被拆解成了多个小体量的阶梯式关卡，可以更加轻松的逐个击破。轻松的流程也将门槛拉低了许多，阶段性的目标则会转为“最终目标”。因此也丢掉之前过于单一的玩法形式，角色则会从大学校长转变为博物馆长。
从经营模拟方面看来依旧属于轻度，但比前作会更加友好简单。游戏中的员工变得更加只能，总能快速的补上空缺位置，只要老板没有那么黑心就不用担心他们每天要求涨薪了。参观的游客可以看做是长了腿的钱包，因此需要对空间管理更加灵活。博物馆的恶心技能是展示，所以不能执着于房间的概念，需要将展示品放置在那些游客愿意去到的敌方。装饰物则是用来增加展示品数值的，在没有了房间的束缚后会看到更直观的范围效果。如果玩家比较功力且不在乎没管，可以考虑将展示品集中在一起。“双点”系列的数值变化是推动循环的核心，而光依靠门票赚钱是不现实的。
所以要将目光集中在那些已经花钱进入博物馆的游客闪烁，除了贩卖周边和饰品，还可以用另一种方式盈利那么就是自觉捐款。展示品自带数值是可以让博物馆的评价提高的，从而吸引更多的游客，欣赏展品后的捐款概率也会增加，虽然是否捐款主要看游客的偏好。所以玩家需要对数值和空间结构进行一定的敢于，也就是说没有必要去照顾每个游客的偏好，只要确保藏品是被正确展示的即可。没有房间限制后可以完全按照自己的需求定制博物馆，无论是展示品的摆放位置还是博物馆中的细节设计。
评价系统和之前的作品相比是有了升级的，变成了“阶段性目标”，不再和地图进行绑定而是属于剧情里的一部分。虽然强制玩家完成但也乜有任何压力存在，剧情的呈现也是非线性的，主要目的是推进故事近战得到评价。因此在游戏的过程中需要在不同的地图，以及多个主题中完成博物馆的经营。而博物馆的主题涉及是很广泛的，包含了太空文明、科学、超自然以及自然历史。
